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疾病动物模型数字化图谱数据库平台的构建与初步应用
2025年07月22日
来源:《实验动物与比较医学》2025年第3期
作者:李会萍 高洪彬 温金银 杨锦淳
责任编辑:lascn
摘要:国内研究机构及研究者们建立了丰富的疾病动物模型,并在模型研发过程中积累了大量极具专业 性、特色性和针对性的图谱数据,这些图谱数据具有极高的开发和应用价值。为此,开发一个专业且完整的疾病动 物模型数字化图谱数据库平台非常必要,可实现动物模型图谱数据的开放共享,以实现国内相关机构所持有的疾病 动物模型图谱资源的整合与优化。
目的 国内研究机构及研究者们建立了丰富的疾病动物模型,并在模型研发过程中积累了大量极具专业 性、特色性和针对性的图谱数据,这些图谱数据具有极高的开发和应用价值。为此,开发一个专业且完整的疾病动 物模型数字化图谱数据库平台非常必要,可实现动物模型图谱数据的开放共享,以实现国内相关机构所持有的疾病 动物模型图谱资源的整合与优化。
方法 笔者单位基于B/S架构,采用Java为主要开发语言,使用Oracle数据库 系统及相关辅助工具搭建疾病动物模型数字化图谱数据库。数据库平台在Linux环境下运行,用户通过Web浏览器 可访问该平台。目前该平台的数据主要来源于广东省内动物模型资源单位汇交的图谱资源。
结果 2024年8月,按 系统疾病、动物种属、资源单位3个维度的图谱分类结构,构建了疾病动物模型数字化图谱数据库平台。该平台可 实现图谱数据的收集、管理、检索和查看等功能。截至2025年1月,该平台已有4个资源单位汇交了动物模型图谱 数据61幅,共610个数据项。
结论 动物模型数字化图谱数据库平台已构建并实现初步应用,虽然平台的数据规模 尚小,但基本可以实现动物模型图谱资源数据的集成和开放共享功能。相信未来随着图谱数据的不断丰富,该平台 有望为实验动物学科发展以及比较医学研究提供重要的数据支撑,从而推动科研资源的高效利用。
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